在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。（本次新编集版在第一季动画基础上追加新场景，以2话合并成1话的形式制作成单集时长1小时的特别篇）

故事开端为第一季故事的七年之后。高达模型对战的规则被革新，亦令其对战更受欢迎。虽然伊织诚和岭司得到第7回敢达模型对战世界大赛的冠军，也令学校圣凤学园沾光不少。不过，其“高达模型对战部”就只剩下部长—国中部3年级学生·星野文奈一人。在新比赛规则底下，如果要参加比赛必须以3人1组的参与战斗。而圣凤学园高达模型对战部郤因为人数不足的情况下难以出场。在偶然的之间，出现了一名转校生，就是跟随师傅修行多年次元霸王流拳法的神木世界。之后，被称为天才高达模型创制家的高坂祐马也加入。终于，星野文奈、神木世界、高坂祐马三人组成了Team·Try·fighters，能够在高达模型对战大赛中登场，向世界大赛展开挑战。

在遥远的未来，一个说不定是被称作为地球也不一定的惑星，有一群全身机械化的武士们在那儿长期的战斗。当大地化为焦土，战争终告终结。人们再次耕种稻田，生产出不至于让生活有困难的数量的米。位于被群山环绕受到湿润气候恩惠的“钪纳村”也正在从战争的伤害中重新站起来，受惠于盛产的稻米。但是村里的人们却不能因为米量的丰渥而快乐起来。因为每年都会有黑色威胁“山贼”——过去再战场上风光一时的机械化武士们，数之不尽的席卷而来。战争终结之后的他们早已失去了生活的目的，转而成群结队的去蹂躏村庄抢夺稻米与女人。抵抗即死--只知道耕作的农民们对于收获期的们的袭击除了无可奈何的接受之外，并没有其它生存下去的方式。对于在收获期之前前来视察稻米状况的山贼，康娜村的长老伪作倡导彻底抗战到底，不过村民们发出了反对的意见。但是伪作早就已经有击退山贼的妙计了，能够对付山贼的只有武士。就这样血气方刚的少年利吉和分配水的巫女云母及小町姊妹代表村庄朝向沙漠另一方的村庄。虹雅渓展开旅程--对于自小生长在纯朴的康娜村的云母们而言，既杂然又人口众多的虹雅渓是个让他们好奇心与困惑感相互交杂的异度空间，为了拉拢武士所带来的米也被小偷给偷去。从小偷手中将米给夺还回来的是名为了修行而来到了虹雅渓的一个叫做胜四郎的年轻武士。虽然小町和利吉马上就想着要拉拢他，但云母却以“没有战场的气息”为由加以拒绝。就在这时出现了一名云母一行人认为“就是他了”的武士，其名为勘兵卫，他将在街头上发生的斗殴事件一瞬间的处理完毕并离去。那耀眼的模样让云母直觉地认为他才是能够拯救村庄的真正的武士……

御苑生奈奈子进入名校青兰女子学园开始了她的高中生涯，在那里她遇到了学校的风云人物折原熏和朝霞丽并与之成为好友。不知为何，全校少女向往进入的“女青社”社长一之宫露子对奈奈子多加照顾，盛邀她成为“女青社”的一员，这同时也激起了众人的嫉妒。丽的痛楚、熏的苦笑还有露子那捉摸不定的态度，一切都源于奈奈子给哥哥的信。

这是个人造的世界，一个充满不可思议的力量的地方。一群十四，五岁的孩子在灾难来临的时候，不经意却又无可避免的落如了这个神秘的空间内。《无限的未知》是近期看的片子内唯一一部与众不同的TV版动画，透过一群孩子在无成人带领的情况下，生活在名位“利维亚斯”的宇宙船内，被外面的世界背叛，诬陷为恐怖份子后的几个月的逃亡生活。当有人聚集的地方就会形成一个社会；当人群遭受灾难即会出现骚乱，暴动；当面临未知的命运时就会有不安，恐惧。所以当这些事落在一群孩子身上，表现的更加强烈。诱骗、隐瞒、强压、暴力都无法抑制越来越中的不按，当面对外面的强敌时可以安心的依靠利维亚斯神奇的力量，可面对那一张张同自己一样不安的脸时却无能为力。在这样的状况下擦发现自己的力量多么渺小，并不是拼命努力就可以了， 再也无法像以前一样压抑着不满微笑对人了。所有的人都变得更敏感，如一根被绷得过紧的弦只要是一阵风就会被震断，响声震耳欲聋。和一般的动画不同之处就在于，《无限的未知》并不仅仅是描写一部机械与战争的热血漫画，在这部片子里我们看到的更多的是当绝望充斥着整个利维亚斯内，每个平凡人的表现。并且编导用了一个比较特别的表现形式，那就是自始至终出现在利维亚斯内的神秘少女。一个开始感觉如rei般的女孩，一个单纯到近乎白纸的女孩，一个从未接触过外人完全不了解人心的女孩。在这个船舱内如若无人境地的走动，感受着没一个人的恐惧，悲伤和绝望。于是这个开始面无表情的女孩变得会笑、会哭、会忧伤、会愤怒，然后更加强大。为什么要这样？！为什么？！好痛苦！好悲伤！可是我不想死！！我想活下去！！所以利维亚斯有了更强大的力量，于是每次都能绝处逢生，因为想活下去的信念超越了所有的情感和障碍。利维亚斯一个神秘的世界，利维亚斯人类科技的产物，利维亚斯如白纸般的少女，利维亚斯——无限的未知。

运气绝佳的小樱（丹下樱 配音）在买文具时，抽中了特等奖，去往香港的旅行。这个意外之喜让小樱极其兴奋。最后商讨出的结果就是小樱、知世（岩男润子 配音）、桃矢（关智一 配音）及雪兔（绪方惠美 配音）四人一起去香港游玩。四人到达香港后，小樱捕捉到了奇怪的气息，一直尾随着四人。在追逐的过程中，小樱意外与小狼（熊井素子 配音）和莓玲（野上尤加奈 配音）相遇。四人于是被小狼带回了家作客。小樱在小狼家做了奇怪的梦，事后被小狼的母亲占卜，告知原因是因为小樱强大的力量易招引魔力，且告知小樱要警惕水。梦中的景象似乎是预告，而这次香港之行似乎冥冥之中被谁操控着……

时间缓缓流淌，16岁的东京少女松前绪花（伊藤加奈惠 配音）在外婆（久保田民绘 配音）经营的温泉旅馆喜翠庄度过了一段快乐而难忘的时光。石川县迎来秋高气爽的时节，和仓结名（户松遥 配音）被福屋老板娘拜托来到喜翠屋修行，这个快乐外向的女孩令这里增添不少的生气。结名在打扫时不小心弄乱存放杂物的房间，绪花赶来收拾时，偶然发现了一本豆丁爷爷的日记。令她颇感意外的是，里面记录了母亲皋月（本田贵子 配音）年轻时候的叛逆经历，以及她在十数年前与外婆争吵、和绪花的父亲邂逅的往事。本片为P.A.Works公司成立十周年原创纪念作品，是同名动画片的剧场版。

时间缓缓流淌，16岁的东京少女松前绪花（伊藤加奈惠 配音）在外婆（久保田民绘 配音）经营的温泉旅馆喜翠庄度过了一段快乐而难忘的时光。石川县迎来秋高气爽的时节，和仓结名（户松遥 配音）被福屋老板娘拜托来...

劳碌半生的平田周造（桥爪功 饰）定年退休，而今这个老头优哉游哉，日常和老友们打高尔夫球散心，玩乐过后再来到居酒屋和风韵犹存的老板娘佳代（风吹纯 饰）调笑一番，生活好不惬意。这一日，当他一如往常醉醺醺回...

在平田周造（桥爪功 饰）与妻子富子（吉行和子 饰）闹离婚后的数年，长男幸之助夫妇担心高龄者的危险驾驶，计划让老爸周造还掉自己的驾照，然而顽固的周造偏不还，让平田家族里再次蒙上不安的氛围。某日，周造与居...

Zee（娜塔莉·伊曼纽尔饰），一个神秘而臭名昭著的刺客，在巴黎黑社会中被称为“死亡女王”，令人闻风丧胆。在她的神秘导师兼经纪人Finn（萨姆·沃辛顿饰）派遣的任务中，Zee拒绝在巴黎一家夜总会杀死失明的年轻女子Jenn（戴安娜·西尔弗斯饰）。这使得她和Finn反目，同时也引起精明的警探Sy（奥玛·西饰）的注意，并使她陷入一场与自己的过去发生冲突的邪恶犯罪阴谋。

童年兄弟意外失散，30年后因一桩罪案相见，两人已身处不同阵营。随着对罪案调查的深入，一个多年来隐于幕后的恐怖组织渐渐浮出水面。